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车辆停放在车库收到违停短信是否违法，取决于具体情况。
如果车辆停放在车库中，而这个车库是合法且合规的（已经获得相关停车许可，并按照规定的停车标准进行操作），同时车主没有违反任何停车规定，那么收到违停短信是不合法的。
但如果车辆停放的地点并非合法车库或者停车区域（禁止停车路段、人行道等），或者车库内部存在违规行为（如超出车库范围停车等），那么收到违停短信是合理的，此时车主应当按照短信提示及时处理，避免因为违规停车造成不良影响。
是否违法取决于车辆停放的具体情况和所在地的法规，如有疑问，建议联系当地交通管理部门或法律顾问，以获取更详细和准确的解答。